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病原体ゲノム情報を活用した高精度な病原体解析に関する研究(1812-07-2)
- 研究期間
平成31年4月1日~令和4年3月31日
- 検体採取期間
平成31年4月1日~令和4年1月31日
- 研究責任者
細菌課研究員
若林友騎
- 研究概要
大阪府内で発生した細菌性感染症起因菌について、病原体ゲノム情報を取得します。取得した病原体ゲノム情報を用いて高精度な病原体解析(遺伝子系統解析や病原因子の網羅的探索)を実施し、大阪府内における感染症の流行動態を解析します。
- 研究に用いる試料、情報の種類
試料:菌株
情報:性別、年齢、発症日、検体採取日、診断名、症状、ワクチン接種の有無、抗生物質の投与の有無
- 外部への試料・情報の提供
共同研究機関へは菌株と匿名化した情報のみを提供します。
- 共同研究機関
国立感染症研究所 黒田誠、関塚剛史